Проверьте инструмент HLScan от MS.
«Отображает жесткие ссылки на томе NTFS или в указанных файлах или каталогах тома».
Это часть набора ресурсов Windows.
Вот прямая ссылка для загрузки версии 2000 для JUST этой утилиты (она работает на XP).
Вы можете, вероятно, выкопать специальные наборы ресурсов для XP или 2003, выполнив поиск по сайту загрузки MS; те могут иметь более новую версию утилиты в них.
НТН.