Установщик Kubuntu включает в себя возможность полного шифрования диска (*) с помощью LUKS (вся ваша система зашифрована) (это то, что я использую ...).
LUKS почти не уступает шифрованию дисков.
(*) осторожно, когда вы вводите первую клавишу, клавиатура отображается на QWERTY US. Если вы используете другую раскладку, лучше ввести простой ключ, не зависящий от раскладки, и изменить его позже на реальную клавишу (реальная раскладка клавиатуры будет использоваться во всех других случаях).