Я думаю, вы сможете заставить это работать с настройкой xmodmap. Ознакомьтесь с разделом «Мышь» в документации сообщества Ubuntu, особенно с записями для многокнопочной мыши и мыши Logitech Marble Mouse USB.
Вы также найдете эту статью об изменении кнопок мыши с помощью xmodmap полезной.