Сборка R-3.5.0 на CentOS 6.5: / usr / bin / ld: crtbegin.o: такого файла нет

237
user8121557

Поскольку у меня нет привилегий использовать инструмент управления пакетами в нашем кластере, я пытаюсь локально собрать R-3.5.0 на CentOS 6.5 из исходного кода. У нас установлена ​​старая версия R для всех пользователей, но для программного обеспечения, которое я использую, требуется более новая версия. Кроме того, компилятор gcc, установленный глобально, слишком стар, чтобы настроить R-3.5.0, поэтому я установил новую версию.

Информация об ОС:

$lsb_release -a LSB Version: :base-4.0-amd64:base-4.0-noarch:core-4.0-amd64:core-4.0-noarch:graphics-4.0-amd64:graphics-4.0-noarch:printing-4.0-amd64:printing-4.0-noarch Distributor ID: CentOS Description: CentOS release 6.5 (Final) Release: 6.5 Codename: Final 

информация о gcc:

$gcc -v Using built-in specs. COLLECT_GCC=gcc COLLECT_LTO_WRAPPER=/home/me/GCC-8.2.0/libexec/gcc/x86_64-pc-linux-gnu/8.2.0/lto-wrapper Target: x86_64-pc-linux-gnu Configured with: /dir/path/me/software/objdir/../gcc-8.2.0/configure --prefix=/home/me/GCC-8.2.0 --enable-languages=c,c++,fortran,go --disable-multilib Thread model: posix gcc version 8.2.0 (GCC) 

Команда для настройки R:

./configure --prefix=$HOME/local --with-cairo --with-blas --with-lapack --enable-R-shlib --with-x=no LDFLAGS="-lcurl -L/$HOME/local/zlib-1.2.11/lib -L/$HOME/local/bzip2-1.0.6/lib -L/$HOME/local/xz-5.2.3/lib -L/$HOME/local/pcre-8.41/lib -L/$HOME/local/curl-7.61.0/lib -L/$HOME/local/ssl/lib -L/$HOME/local/texinfo-6.5/lib -L/$HOME/local/texi2html-5.0/lib -L/$HOME/GCC-8.2.0/lib" CPPFLAGS="-I/$HOME/local/zlib-1.2.11/include -I/$HOME/local/bzip2-1.0.6/lib -I/$HOME/local/xz-5.2.3/lib -I/$HOME/local/pcre-8.41/include -I/$HOME/local/curl-7.61.0/include -I/$HOME/local/ssl/include -I/$HOME/local/texinfo-6.5/include -I/$HOME/local/texi2html-5.0/lib/include -I/$HOME/GCC-8.2.0/lib/include" 

Результирующая ошибка:

checking for gcc... gcc checking whether the C compiler works... no configure: error: in `/dir/path/me/software/R-3.5.0': configure: error: C compiler cannot create executables See `config.log' for more details 

config.log:

configure:6158: gcc --version >&5 gcc (GCC) 8.2.0 Copyright (C) 2018 Free Software Foundation, Inc. This is free software; see the source for copying conditions. There is NO warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  configure:6169: $? = 0 configure:6158: gcc -v >&5 Using built-in specs. COLLECT_GCC=gcc COLLECT_LTO_WRAPPER=/home/me/GCC-8.2.0/libexec/gcc/x86_64-pc-linux-gnu/8.2.0/lto-wrapper Target: x86_64-pc-linux-gnu Configured with: /helga/cluster/me/software/objdir/../gcc-8.2.0/configure --prefix=/home/me/GCC-8.2.0 --enable-languages=c,c++,fortran,go --disable-multilib Thread model: posix gcc version 8.2.0 (GCC) configure:6169: $? = 0 configure:6189: checking whether the C compiler works configure:6211: gcc -I//home/me/local/zlib-1.2.11/include -I//home/me/local/bzip2-1.0.6/lib -I//home/me/local/xz-5.2.3/lib -I//home/me/local/pcre-8.41/include -I//home/me/local/curl-7.6$ /usr/bin/ld: crtbegin.o: No such file: No such file or directory collect2: error: ld returned 1 exit status configure:6215: $? = 1 configure:6253: result: no 

Я понимаю, что проблема заключается в том, что crtbegin.oэто не найдено в /usr/bin/ld, но я думал, что это ldбыло связано с gcc. Нужно ли устанавливать ldотдельно gccили я просто gccнеправильно настроил ? Я полагаю, что я запутался в отношениях между ними и о том, как наилучшим образом устранить ошибку.

0

0 ответов на вопрос

Похожие вопросы