Ссылка, которую вы цитируете, гласит:
Вы не должны касаться каких-либо томов, которые были смонтированы на этом компьютере (то есть любые разделы FAT32 или NTFS, которым назначена буква диска в спящем режиме ОС).
Я полагаю, это означает, что до тех пор, пока Linux не смонтирует раздел Windows в спящем режиме, с Windows все будет в порядке.
Статья предупреждает, что монтирование спящего раздела Windows может привести к катастрофическому отказу Windows.
Я хотел бы отметить, что определение одной ОС в качестве виртуальной машины внутри другой решит все эти проблемы, если вашей оперативной памяти достаточно.