После нескольких попыток неудачной установки Windows прошлой ночью, теневые копии снова работают. Я думаю, что форсирование проверки C: помогло.
PS Через некоторое время проблема снова появилась. Причиной теперь являются диски SoftPerfect RAM. После того, как я удалил их, он снова работает.