Потому что диспетчер задач округляет или уменьшает значения использования ЦП для каждого процесса. Вы можете видеть много процессов, использующих процессор "0%", это неверно, они фактически используют процессор "0.xxxxxx%". Менеджер процесса покажет вам более точное значение. Некоторые процессы также могут быть скрытыми (отрицательный PID, запущенный от имени другого пользователя), или некоторые аппаратные средства могут иметь прямой доступ к ЦП, передавая вашу операционную систему (но, вероятно, нет).
Запустите Process Explorer, и вы увидите загрузку процессора для всего, включая процесс, запущенный на другом пользователе Windows.