Один неохотный процесс может замедлить или остановить процесс выключения. Лучше всего проанализировать запущенные процессы / службы, например, с помощью HijackThis и Process Explorer, и удалить ненужные.
Перезагрузите компьютер и повторяйте, пока процесс выключения не станет плавным.