Сжатие файлов может вызвать такие проблемы. Я часто сталкивался с этим на работе, когда клиенты использовали сжатие, и оно сжимало файлы базы данных для SQL Server. Некоторые программы просто не будут работать на ВСЕХ с файлами, к которым им нужен сжатый доступ.
Распакуйте хотя бы все файлы для этой программы и посмотрите, исправит ли она это. Я бы порекомендовал распаковать ВСЕ ваши файлы, так как это может быть общий DLL-файл в папке Windows, который вызывает проблему, или файл, не входящий в структуру дерева каталогов для этой программы.
Для # 2 все AV-программы, которые запускают защиту в реальном времени, немного снижают производительность (обычно это не заметно). Это цена, которую вы платите за сканирование каждого файла до того, как он может причинить вам вред. Я использую Avast, и он работает отлично, а также бесплатно, если вы хотите попробовать. AVG должно быть хорошо, если только они действительно не изменили что-то в самой последней версии.