Вы должны убедиться, что сервер emacs запущен. Добавьте следующее в ваш файл .emacs:
(server-start)
А затем всегда используйте emacsclientw.exe для запуска emacs.
Для справки я использую файл emacs.cmd, который выглядит следующим образом:
@echo off if "%1"=="" goto nofile start "" "c:\emacs\bin\emacsclientw.exe" -n %* goto end :nofile start "" "c:\emacs\bin\runemacs.exe :end
Экземпляр runemacs вызван тем, что emacsclientw требует, чтобы вы указали имя файла.