Поскольку вы не указали, какую ОС вы используете, я бы порекомендовал Handbrake как отличный бесплатный кодер mp4 / h264. Он кроссплатформенный и имеет опции для Windows, Mac и Linux.
У него есть графический интерфейс, но вся реальная работа выполняется в программе командной строки, которая на моем компьютере находится в каталоге установки как HandBrakeCLI.exe. Существует руководство по использованию версии командной строки на https://handbrake.fr/docs/en/1.1.0/cli/cli-guide.html, но, возможно, оно несколько устарело ( но, вероятно, все еще в значительной степени актуальны), поскольку на этой странице есть примечание об этом .
Он многопоточный и может легко использовать все имеющиеся у вас процессоры.