Есть несколько причин, по которым ваш диск будет проверяться каждый раз при загрузке.
Обычно это связано с тем, что на диске есть ошибки, и вам еще предстоит их исправить. Сканирование во время загрузки не всегда может исправить ошибки и просто сообщит о необходимости вмешательства человека.
Также возможно установить флажок на томе для сканирования каждый раз. Проверьте tune2fs... конкретно -cфлаг.
Установка "fsck.mode = force" в качестве параметра загрузки ядра может принудительно проверять каждую загрузку ... возможно, кто-то / что-то обновил параметры загрузки.
Я видел, где файл «forcefsck» в корне воссоздается процессом, работающим на машине, но это скорее «легкая вероятность», чем вероятная.