Хотя я не знаю ошибок копирования при входе в систему, может быть проще использовать инструмент сравнения, такой как бесплатный Meld или альтернативный метод .
Тем не менее, это может занять некоторое время, чтобы изучить весь диск, поэтому я бы начал эту операцию, когда вы закончите на сегодня.