mods-available/
поставляется по умолчанию с FreeRADIUS 3.x (Ubuntu 17.04 Zesty или Debian Stretch).
В более ранних версиях modules/
содержались в основном те же файлы, но они не были такими согласованными. В серии 2.x (которая есть в вашей версии Ubuntu) конфигурация SQL живет, /etc/freeradius/sql.conf
а некоторые настройки немного отличаются.