Используйте установочный файл https://github.com/git-for-windows/git/wiki/Silent-or-Unattended-Installation.
Вы также можете загрузить параметры установки из файла с параметром / LOADINF = "имя файла" и записать параметры в файл, используя / SAVEINF = "имя файла".
Пример файла параметров:
[Setup] Lang=default Dir=C:\Program Files (x86)\Git Group=Git NoIcons=0 SetupType=default Components= Tasks= PathOption=Cmd SSHOption=OpenSSH CRLFOption=CRLFAlways
Дополнительную информацию о параметрах командной строки можно найти по адресу http://www.jrsoftware.org/ishelp/index.php?topic=setupcmdline.