Для работы PAE вам понадобится как система, так и приложение, которое его поддерживает. У вас есть система (ядро), но не все приложения увидят ее, поскольку они обычно не компилируются таким образом.
Только приложения, в которых разработчик предпринял дополнительные шаги, смогут использовать эту память. Обычно эти приложения относятся к числу тех, которые требуют много памяти. MySQL в качестве стандартного примера приходит на ум.
Хотя ваша система и большинство ваших приложений видят только 3 ГБ, вы можете быть уверены, что некоторые приложения (например, MySQL) будут знать, как его использовать.