После публикации в списке рассылки я получил ответ, что удаление нескольких строк возможно только в том случае, если они являются последовательными: https://mail.gnome.org/archives/gnumeric-list/2015-De December/ msg00001.html
Я открыл запрос на улучшение, чтобы добавить возможность удалять несколько непоследовательных строк: https://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=758997
Я надеюсь, что разработчики Gnumeric реализуют эту функцию в будущем.