Ubuntu 16.04 и его производные в настоящее время поставляются с GPG 2.1.11, которую нельзя использовать без агента. Более того, начиная с 2.1, файл сокета агента фиксируется на $/S.gpg-agent. Причина, по которой я это говорю, заключается в том, что я не знаю точно, как gpg-agentи как gnome-keyringбороться за то, чтобы действовать как агент, владея этим файлом, но только один может владеть им в любой момент.
Тот факт, что был установлен флажок для сохранения пароля, говорит о том, что вы использовали не pinentryчерез gpg-agent, а через Seahorsegnome-keyring . Я предлагаю прочитать раздел «Управление паролями» и попытаться найти плохую связь (пустой проход для этого конкретного файла) таким образом.
Так как вы упомянули, что ищете ключ в Seahorse. Если вы используете симметричное шифрование, пароль не будет связан ни с одним ключом шифрования GPG. (Я считаю, что GPG не хватает в этом отношении, подробности здесь .)