Я использовал Ubuntu для устранения многих проблем MBR с дисками Windows.
Загрузка с USB с установленной Ubuntu: http://www.ubuntu.com/download/desktop/create-a-usb-stick-on-windows
Установите Boot-Repair: https://help.ubuntu.com/community/Boot-Repair
На экране «Основные параметры» графического интерфейса Boot-Repair установлен флажок «Восстановить MBR».
Еще одна ссылка, если вы хотите более подробные шаги: http://www.howopensource.com/2011/08/restore-mbr-from-ubuntu-live-cd-usb/
В ответе о GRUB приведем команды для восстановления без использования Boot-Repair.
На терминале:
Установите ms-sys: sudo apt-get install ms-sys
Список дисков: sudo fdisk -l
Запустите команду MBR и замените [диск]: ms-sys --mbr /dev/[drive]
Например: ms-sys --mbr /dev/hda