Решил это! Произошла ошибка в способе загрузки EasyBCD недавно развернутого хранилища BCD.
После развертывания хранилища BCD просто проигнорируйте окно сообщения с просьбой загрузить хранилище, выберите «Выбрать хранилище» в меню «Файл» и загрузите его таким образом.