Очевидно, было бы неплохо, если бы была некоторая настройка конфигурации, которая бы исправила поведение, которое вы испытываете; если есть, надеюсь, кто-то еще опубликует это.
Но, скорее всего, нет, и эта функция инструмента просто сломана. Вы уже нашли правильный обходной путь - найдите другой инструмент и используйте его вместо этого. Но, как вы говорите, это не идеально.
Одна вещь, которую вы обязательно должны сделать, это проверить панель запуска Ubuntu на наличие ошибок Okular и сообщить об этом, если ее еще нет в списке. (Похоже, что это не так, но мой поиск не был очень тщательным.) Пакеты Ubuntu в основном являются свободным программным обеспечением, разработанным добровольцами, и отчеты об ошибках помогают сделать программное обеспечение лучше.