На самом деле произошел конфликт GPT SSD с жестким диском емкостью 1 ТБ (MBR), который имел расширенный раздел, который я создал перед первым отключением сервера. Даже если бы не было перестановки RAID / AHCI, проблема возникла бы, это было просто незнакомое знакомство. Раскрывая конфликт ЗДЕСЬ, удаляет вторичные разделы hd и преобразует его в GPT, и проблема была решена.
Вкратце: Windows обнаруживает расширенный раздел на диске MBR, например, загрузочный диск UEFI, что вызывает конфликт. Существует исправление здесь и здесь, но они должны быть применены при установке операционной системы.