В синтетических тестах на чистом тестировании пропускной способности памяти вы увидите, что 8-канальные слоты PCIe явно медленнее. (Это не имеет никакого значения для вычислительной производительности графических процессоров.)
На практике разница, вероятно, не будет заметна, если только у вас нет очень необычного варианта использования, который часто требует насыщения пропускной способности для графических процессоров. (То, что предполагает непрерывное перемещение больших наборов данных между основным ОЗУ и графическим процессором или между двумя видеокартами.)