Я просто пытаюсь сделать то же самое обновление и с MySQL Workbench также установлен. Мое обновление не удалось: Ошибка проверки транзакции: файл /usr/lib64/libzip.so.4.0.0 из установки libzip-1.1-1.fc23.x86_64 конфликтует с файлом из пакета libzip-last-1.1.3- 1.fc22.remi.x86_64
Когда я инициировал dnf-удаление libzip-last, mysql-workbench-community был среди тех вещей, которые будут удалены, поэтому я знаю, что libzip-last является зависимостью. Затем я установил остальные элементы вручную, и они завершились без запроса libzip-last, так что это зависимость ТОЛЬКО от рабочей среды.
Я повторил свое обновление, теперь без libzip-last ... загрузка пропустила все уже загруженное, и она успешно завершена и ожидает перезагрузки. Я буду ждать завершения обновления, прежде чем переустанавливать Workbench.