Из документации Mutt вы можете контролировать, будут ли непрочитанные сообщения помечены как старые (с O вместо маркера N ) при выходе из программы:
3,122. mark_old
Тип: логическое значение По умолчанию: да
Определяет, будет ли Mutt помечать новые непрочитанные сообщения как старые, если вы выходите из почтового ящика, не читая их. Если эта опция установлена, при следующем запуске Mutt сообщения будут отображаться с «O» рядом с ними в индексном меню, указывая на то, что они старые.