Если вы обновились до сервера Ubuntu 16.04 и используете 5.7.12, вы сталкиваетесь - по крайней мере частично - с ошибкой, потребляющей ОЗУ, и с некоторыми динамическими оптимизациями / настройками по умолчанию, которые основаны на доступной ОЗУ сервера и установить меньше, чем в идеале. Это было проблематично для многих людей, но особенно для небольших серверов / VPS с низким объемом оперативной памяти.
Поиск laracasts.com для утечки памяти MySQL 5.7
https://www.reddit.com/r/mysql/comments/4gnj93/mysql_5712_ubuntu_1604_ridiculous_memory/
Есть и другие проблемы, некоторые из которых 5.7.13 исправлены, конечно ...
http://mysqlentomologist.blogspot.com/2016/06/fun-with-bugs-43-bugs-fixed-in-mysql.html
Были также сделаны некоторые различные оптимизации / изменения, которые будут иметь влияние, в зависимости от того, используете ли вы InnoDB или MyISAM. В качестве примера: недавно установленный VPS с 2 ГБ ОЗУ, который потребляет около 320 МБ ОЗУ, при перезапуске MySQL будет медленно расти до потребления 1 ГБ в режиме ожидания, в режиме обслуживания ... с нулевым трафиком или запросами в дБ (что была установка OpenCart, которая использует MyISAM ... что я не хотел бы пожелать, чтобы кто-то пытался двигаться вперед ... но это был случай "поторопись и давайте сделаем это и будем использовать это и ...."), И поэтому этому конкретному экземпляру требуется больше $ и времени, чтобы вернуться и справиться с той же самой проблемой низкой производительности MySQL из-за зависимости от MyISAM в приложении, утечки памяти и некоторых плохих настроек по умолчанию, которые команда Oracle выбросила на волю.
Конечно, вы хотите, вероятно, оптимизировать свои запросы и объединения для новых обновлений. Но, в то же время, вы, вероятно, будете тратить много сил и ничего не делать из-за утечки основной памяти, как, например, проблема с ситом. Если вы собираетесь пройти оптимизацию, вы можете также сделать это с сервером MySQL, отличным от того, который вызывает у вас проблемы.
Ваши варианты, учитывая, насколько медленно MySQL исправляет ошибки:
1) езда и ожидание обновлений репо, которые это исправят
2) удалить текущую версию и вернуться к предыдущей (но почему?)
3) заменить его на MariaDB или Percona
Если вы запускаете новый сервер Ubuntu 16.04, я бы изменил репозитории перед подключением любых пользовательских агентов удаленного администрирования или установкой панелей управления сервером, чтобы вы были на треке MariaDB / Percona. Или отслеживание официальных репозиториев MySQL, а не репозиториев Ubuntu, чтобы быстрее получать исправления.
Безопасное и незамедлительное решение (безусловно, более разумное, чем продление использования более ранних версий с ошибками и основной точкой прерывания совместимости в потоке выпуска) - это переключение на MariaDB или Percona. Или, если вы используете приложение, которое может использовать PostgreSQL, а также MySQL, переключитесь на Postgre - если это что-то непрактичное.
Я не стал бы тратить свое время на оптимизацию базы данных, пока не обновлюсь до 5.7.13 и не проверил результаты или не переключился на MariaDB или Percona. Оптимизация / устранение неполадок 5.7.12 - это просто черная дыра, высасывающая ваше время и ресурсы.