Я хотел бы убедиться, что ACPI и APIC и все остальное включено для материнской платы, а также в Ubuntu. Материнская плата может иметь только драйверы, совместимые с Windows, из-за некоторых особенностей их изготовления.
Вы не упоминаете, сколько лет системе. По моему опыту, только последние несколько лет Compaq очень хорошо играли с Linux.