Никогда не слышал о такой вещи. Это можно сделать, проверив сообщение об ошибке, а затем запросив пароль. Однако это модификация Nautilus, а не простое дополнение, так как я не думаю, что Nautilus поддерживает такие дополнения. (Думаю, вы могли бы написать это на странице фрилансера кода. Вы платите x $, если кто-то пишет форк наутилуса с этой функцией. Ну ... не долгосрочное решение.)
По сути, вы можете написать сценарий .sh для резервного копирования и запустить его с помощью sudo, ИЛИ просто использовать sudo cp -R... что-то в этом роде. (Rsync?)