Единственная известная мне возможность контролировать поведение при удалении приглашений на собрания - это то, что вы упомянули: удалять приглашения на собрания и уведомления из папки «Входящие» после ответа. Согласно моему тестированию, когда эта опция не отмечена, приглашение на собрание должно быть удалено после ответа. Возможно, вы можете попытаться создать новый почтовый профиль Outlook и настроить свою учетную запись электронной почты в новом профиле, а затем посмотреть, сохраняется ли эта проблема.
Кроме того, если возможно, попробуйте настроить учетную запись электронной почты на другом компьютере и посмотреть, следует ли проблема с учетной записью.