Это известная проблема: время автономной работы Magic Mouse приводит к исчезновению
Вот два совета по ссылке выше.
Волшебная мышь, как предполагается, входит в спящий режим, когда обнаруживает неиспользование, что должно помочь продлить срок службы батареи. Выключение Magic Mouse вручную, когда вы закончите с ним, с выключателем на животе мыши, должно помочь продлить срок службы батареи немного дальше.
Другой вариант, чтобы получить максимальную отдачу от батарей Magic Mouse - заменить их на литий-ионные AA или перезаряжаемые NiMH (никель-металлогидридные) батареи.