Короче говоря, никакие функции не будут удалены, если вы не используете программу в коммерческих целях. Коммерческое использование означает получение денег за то, что вы делаете с программой.
В основном это означает, что можно повеселиться для развлечения, неоплачиваемого обучения и неоплачиваемой благотворительности.
На их сайте есть ссылка, которая объясняет все это: http://www.phraseexpress.com/freeware.htm
К вашему сведению, вот что написано на их сайте: 
Если вы хотите бесплатное решение, которое вам разрешено использовать в коммерческих целях, обратитесь к AutoHotkey ( http://www.autohotkey.com/ ).