Угадайте: какое бы соединение вы случайно не установили (из описания не совсем понятно, какие у вас разъемы и как они работают) вызывало короткое или почти короткое замыкание с высоким током, что приводило к отключению питания сети, а также разрушало часть контроллер вентилятора. Что теперь будет работать, только если вы установите переключатели в положение, в котором не используется разрушенная часть.
Не зная, как все работает, т.е. схемы, где вы видите, из чего состоит контроллер вентилятора и что он делает, нет никакого шанса отремонтировать его.
Для начала вы можете отредактировать вопрос, указав точную модель вашей материнской платы и корпуса, поищите в документации по ним и опишите, как все подключено, сколько контактов задействовано и какое напряжение у них есть (измерить).