Когда вы имеете в виду обрезку - вы имеете в виду, что она не синхронизирована, слишком коротка, громкость повсюду или кажется, что вы не получаете весь звук?
Фильмы 1080p - есть ли у них звук 5.1 (или 7.1)? На вкладке Аудио вы микшируете звук в стерео или оставляете его как есть?
Коэффициент преобразования видео не будет иметь никакого отношения к аудио - проверьте, какие настройки находятся на вкладке аудио. Следует отметить, что iPad будет поддерживать только стереозвук в AAC до 320 кбит / с.