Вы не можете удалить эту папку. Это сборочный кеш.
Из ТФА:
В папке Winsxs хранятся несколько копий DLL, чтобы позволить нескольким приложениям работать в Windows без проблем совместимости.
Ссылка: http://www.winvistaclub.com/f16.html
РЕДАКТИРОВАТЬ: compcln.exe, часть Vista SP2, позволяет удалить файлы RTM и SP1 из кэша, но не позволит вам вернуться к предыдущей версии, если вы этого хотите. Средство очистки пакета обновления - это замена Vsp1cln.exe из Vista SP1, которая сделала то же самое. Подробнее здесь .