Это один и тот же формат. Моя компания Design Science создает редактор уравнений, который поставляется с Microsoft Office для Mac и Windows с 1991 года или около того. MathType - это модная версия редактора уравнений с множеством дополнительных функций, включая функцию ввода TeX, о которой вы упомянули. Следует рекомендовать вашему издателю упомянуть, что он принимает уравнения MathType и Equation Editor, как и большинство издателей. Я подозреваю, что они получали документы, содержащие уравнения MathType, и все время прекрасно с ними работали.
Кстати, следующая версия MathType будет поддерживать совместимость с Mac Office 2011, выход которого ожидается в конце этого месяца. Как вы, возможно, знаете, Microsoft исключила поддержку Visual Basic для приложений (VBA) в Office 2008, но они возвращают ее в этой новой версии. Это означает, что MathType будет иметь больше команд, чем в Office 2004. В частности, вы сможете вставлять новые уравнения, не проходя процесс вставки объекта.