Ваш вопрос не очень ясен (относительно вашей ОС или того, что вы пытаетесь сделать). Вы можете подключать HDD через USB под Linux, используя программный рейд (MDADM)
Я предполагаю, что вы вообще не захотите использовать RAID-накопители с USB2 или медленнее, потому что производительность будет ужасной. Теоретически USB3 должен работать нормально, но если вы абстрагируетесь от интерфейса SATA (или любого другого), они вряд ли будут работать так же хорошо.
Наличие каждого устройства на собственном порте USB3 даст вам лучшую производительность, чем если бы они проходили через концентратор, разделяющий один порт USB, поскольку таким образом доступно больше устройств для каждого устройства.