Вы в значительной степени покрыли плюсы и минусы обоих вариантов.
Нарушение производительности программ, запускаемых из внешней памяти: это зависит от программы и вашей системы, вам нужно проверить, важно ли это для вас.
Потеря данных из-за сбоев SD-карты: в настоящее время решения облачной синхронизации довольно хороши и дешевы (~ бесплатны), независимо от того, где вы храните свои данные, вы должны также синхронизировать их с дополнительным местоположением.
Я действительно рекомендую запускать хотя бы самые тяжелые / наиболее часто используемые программы с вашего SSD.
В зависимости от ваших потребностей, 64 ГБ будет недостаточно даже для хранения Windows и всех ваших программ, вам, вероятно, придется расставить приоритеты.