От man 8 mkisofs
:
-cache-inodes
Кэшируйте индексы и номера устройств, чтобы найти жесткие ссылки на файлы. Еслиmkisofs
найдена жесткая ссылка (файл с несколькими именами), то этот файл появится на компакт-диске только один раз. Это помогает сэкономить место на компакт-диске.
В общем, это означает, что на компакт-диске могут быть жестко связанные файлы. Если это так, простое копирование всех файлов нарушит жесткие ссылки и заставит каждый результирующий файл на жестком диске занимать место самостоятельно.