Есть много приложений, которые будут синхронизировать файлы по расписанию или триггеру (например, синхронизировать при подключении к этому Wi-Fi SSID и при зарядке).
Вам нужно будет предоставить способ общения вашего телефона с вашим рабочим столом. Я вижу, что ssh или CIFS подойдут.