В принципе, и PCIe, и PCI могут выполнять горячее подключение / горячее извлечение.
Работает ли это на конкретной системе - это совсем другой вопрос - контроллер должен поддерживать его, разъем должен поддерживать его, и часто карта должна быть специально разработана с несколькими более короткими следами на разъеме.
Итак: если вы точно не знаете, что все компоненты вашей системы специально предназначены для горячего подключения / горячего извлечения, делать это небезопасно. Это может сработать несколько раз, и в следующий раз создаст короткое замыкание или забавную электрическую ситуацию, и некоторые компоненты на плате или материнской плате будут убиты, которые вам все еще нужны.