вы можете установить .net3.0 в Wine, инструкции здесь, в качестве альтернативы вы можете попробовать альтернативу .net с открытым исходным кодом, которая называется mono
Mono - это бесплатный проект с открытым исходным кодом, возглавляемый Xamarin (ранее Novell и первоначально Ximian) для создания совместимого со стандартом Ecma набора инструментов, совместимого со стандартом .NET Framework, включая, среди прочего, компилятор C # и среду выполнения Common Language.