Я так не думаю - например, этот пост в блоге утверждает следующее:
Оба формата представляют собой обертки вокруг необработанного образа диска, поэтому производительность на самом деле не является проблемой.
Тем не менее, это также говорит следующее:
VirtualBox должен смонтировать образ vmdk как сквозной диск, что означает, что он теряет такие вещи, как снимки и, возможно, производительность драйвера.
Я не знаю, относится ли это к новейшей версии, но похоже, что вы должны использовать VDI.