Я считаю, что Screen Watermark должен уметь делать то, что вы ищете. Он доступен в двоичном виде только для Win64, но исходный код доступен и основан на Qt, поэтому должен компилироваться и работать на большинстве платформ. Вот краткий обзор их (редкой) документации:
Экран Водяной знак - это приложение, которое накладывает изображение на рабочий стол и может выступать в качестве гибкого водяного знака на видео или изображениях, снятых непосредственно с экрана. Основное использование - для добавления водяных знаков, когда ваше видео или программное обеспечение для захвата экрана не поддерживает водяные знаки правильно или вовсе.
Файл конфигурации - config.xml. Вы можете изменить начальную позицию по умолчанию.
Связывание клавиш: W: один пиксель вверх S: один пиксель вниз A: один пиксель слева D: один пиксель справа
TGFH: десять пикселей IKJL: двадцать пикселей
N: на 10% более прозрачный M: на 10% менее прозрачный
X: выход
Назовите его с именем файла водяного знака в качестве аргумента.