Никакого количества передачи данных не слишком много. Аппаратное обеспечение, очевидно, имеет максимальную пропускную способность ввода / вывода, но нет необходимости пытаться избежать приближения к этому пределу. Диск имеет конечный срок службы, но запись в один конец части его емкости не изнашивает его.
Загрузка любого объема данных на новый отформатированный жесткий диск не приведет к фрагментации. Фрагментация вызвана смешанным удалением и записью. Некоторые файловые системы в любом случае менее подвержены фрагментации, чем другие.
Если вы беспокоитесь о том, что OSX Spotlight пытается индексировать файлы (для более быстрого поиска) во время загрузки, вы можете отключить его до завершения загрузки.