Простой ответ - Нет. Не без какого-либо стороннего программного / аппаратного обеспечения.
Вентилятор, вероятно, подключен к разъему на карте, который потребляет питание непосредственно из слота PCI-E, его «холостая» (более медленная) скорость является напряжением по умолчанию. Увеличение загрузки / использования (и скорости вентилятора) является управляемым, но для его фактического выключения может потребоваться отключение питания слотов PCI-E (что невозможно).
Самым простым решением было бы другое решение для вентилятора, требующее питания от разъема, которым вы можете управлять (например, от блока питания - просто используйте линейный коммутатор или вентилятор).
Просто имейте в виду, что даже если карта отключена / не используется, она, вероятно, по-прежнему получает напряжение, и существует вероятность повреждения карты при нулевом охлаждении - т.е. пассивного недостаточно.