Это может быть сервер MySQL ограничен или отключен от сети.
Найдите файл my.cnf
и найдите любую из следующих строк в файле в [mysqld]
разделе.
skip-networking bind-address = 127.0.0.1
удалите или закомментируйте эти строки, а затем перезапустите mysqld.
К вашему сведению: mysqld использует TCP-порт 3306 для связи с клиентом.