Mercurial не децентрализован, люди могут иметь копию репозитория на своих машинах, но в какой-то момент они должны будут загрузить свои изменения в репозиторий, который вы определили как «основной», иначе как вы соберете проект или развернете сайт?
Вы все равно сделаете резервную копию основного репозитория, как вы делаете с SVN, вы просто должны напомнить пользователям, что им нужно регулярно загружать свои изменения в основной репозиторий. Это не должно быть большой проблемой, если они использовали SVN, поскольку это было то, что они делали до Mercurial.