Нет, ориентация современного жесткого диска не имеет отношения к его производительности или сроку службы, любое количество статей доступно онлайн для резервного копирования этого утверждения. Хотя рекомендуется (в основном по общепринятому мнению, а не по факту) их форматировать, когда они параллельны или перпендикулярны земле.
Есть что-то еще, что вызывает проблему. Так как вы переместили компьютер, возможно, что жесткие диски были повреждены, но более вероятно, что кабель или RAID-контроллер установлены неправильно.
Требуется дальнейшее расследование, чтобы найти причину проблемы, но ответ на ваш вопрос ясен ... ориентация дисков не является причиной проблемы.