Существует инструмент под названием SyncFolders, который может быть очень полезным для вас.
Вы можете указать типы файлов для копирования и правила исключений.
Удаленные или перезаписанные файлы можно переместить в корзину или в папку истории с отметкой времени, а файлы истории можно удалить по истечении определенного пользователем периода.