У меня была эта проблема с рипами DVDFab (преобразование iso в m4v) всякий раз, когда я оставлял меню без изменений в ISO. Я бы получил 4KB рипы (даже несмотря на то, что DVDFab уже снял защиту от копирования). Так что я не уверен, что это просто проблема защиты от копирования - я думаю, что это законная ошибка в Handbrake (о чем я говорю осторожно, так как это бесплатное программное обеспечение!).
Для этих проблемных ISO я снова загружаю ISO в DVDFab и удаляю меню, затем разрыв с ручным тормозом идет просто отлично.